进站大厅
阳光从屋顶的大片玻璃处透进来，脚下的地板砖铺设大半了，头顶的吊顶也大部分安装好，六部电动扶梯安装完毕。电动扶梯还没有正式启用，被雨布盖着。沿着扶梯走上楼到候车大厅，视线再度扩大，几乎整层楼都是畅通的，四面都有工人在施工，或在高高的桁架上进行焊接，或在吊装玻璃，或在铺设地板，或在对墙体、围柱装饰等。
空中站台
和传统火车站不同的是，合肥南站的布局是立体式的高架结构，可以说合肥南站其实算是一座“建在空中的火车站”。因为列车到发的“站台层”并不是真正的地面，铁路线是铺在10多米高的高架桥上，这座车站标示的一层其实是位于高空的桥面。
候车大厅
候车大厅的幕墙不再是传统建筑物的墙壁，而是高大的柱子加上大面积玻璃，使候车大厅可以实现自然采光，即便多云微阴的天气也不需要开灯。幕墙玻璃安装有拉索、悬挂和明框三种，其中拉索玻璃幕墙面积为4200平米，主要分布在站房四个立面。
南站顶棚
合肥南站屋顶大面积使用玻璃，共有135个天窗，其中27个是全自动的，这些天窗方便调节候车大厅内的温度、光线，比传统方式更加节能。
北广场
南北广场和出站层地面齐平，旅客们出站后，可到北广场区域换乘公交、出租等。
