在笔者看来，由“费”改“税”的意义不仅仅在于通过“税收法定原则”提升执行力和透明度，减少征管腐败，降低征管成本，更在于以税率差异化激励“绿色创新”。具体来说，就是要用税收杠杆影响企业的环境保护行为，这才是“绿色税法”所要承担的长远使命。
市场的力量非常强大，但其并非总是有效率地配置资源，环境产品往往容易出现“市场失灵”。环境产品如空气、草地、森林、海洋等自然资源，往往不具有排他性，在缺乏强有力约束的条件下，往往导致“公地悲剧”和“搭便车”的问题，导致肆意排放污染物、过度捕捞等过度消耗资源的现象出现。但此时，市场是无法提供限制措施的，环保税则恰恰可以在此时纠正“市场失灵”。
税收调节直接影响价格变化，而价格变化则是改变人们行为的有效手段。环境保护税的重要作用不仅仅在于节约资源、减少废弃物排放、限制高能耗产品应用，更在于能激励技术进步，即“绿色创新”。研究表明，企业的排污成本在政府采用征税政策后升高，减排对企业而言收益也会更大，因此，征税将比免费许可证制度（即限制排放）产生更强的减排推动力，也比补贴更能激励创新。当然，这也是国际通行的做法，丹麦在推行生态税收制度后，不仅有效保护了环境，还为符合环保要求的企业发展积累了资金，产生了明显的经济效益。
