为促进产业转型升级，围绕主导产业和各市首位产业，皖江示范区强化科技支撑，实施自主创新重大专项。 2014年，示范区科技型中小企业110个项目获得国家创新基金立项，国家财政支持经费9382万元；172个项目获省科技攻关立项支持；349个项目获省自然科学基金立项支持。同时，高新技术企业队伍不断壮大。截至去年底，皖江示范区拥有高新技术企业1814家，占全省的76.8%，获国家新认定批复547家，占全省的79%；拥有创新型企业248家，占全省的67%。
皖江示范区围绕产业链部署创新链，抓产业关键技术攻关，抓企业创新能力提升，抓重大科技成果转化，抓体制机制改革创新，推动产业向中高端发展，承接产业转移质量和水平不断提高。去年以来，我省运用创新型试点省和合芜蚌自主创新综合试验区建设两大平台，实施创新驱动发展战略，推动示范区成为产业升级和自主创新的新高地。去年1月至11月，示范区战略性新兴产业产值达到5798.8亿元，增长23.5%，高于全省0.5个百分点。前10个月,示范区高新技术产业产值9063.6亿元，增长15.7%；累计授权专利2.9万件，占全省73%。
示范区加快推动重大科技成果转化。中科大先进技术研究院建设进展迅速，截至目前已与微软、阿里巴巴等企业共建32家研发中心，孵化83家创新企业，院内创新单元数量达到115家，引进注册资金2.93亿元；集聚各类人才400多人。合肥、芜湖市新能源汽车示范推广工作推进不断加强，合肥市在全国推广应用城市(群)中位列前茅，推广进度排名全国第一。
此外，皖江示范区高新技术转化应用示范基地建设不断提速。去年新增铜陵狮子山高新技术产业开发区、青阳机械基础件高新技术产业基地，新增21家科技企业孵化器和2家生产力促进中心。截至目前，皖江示范区拥有各类高新技术产业基地30家，占全省的63%；拥有科技企业孵化器63家，占全省的74%；拥有生产力促进中心83家，占全省的65%。
