从2008年起，省财政每年安排5亿至7亿元专项资金，在合芜蚌试验区全面实施升级创新型产业、培育创新型企业、集聚创新人才、建设创新载体、建设创新平台和优化创新环境“六大工程”。合芜蚌三地的科技创新企业可将3年税后利润形成的净资产增值额的35%，以股权奖励、股权出售、股票期权等形式奖励给有突出贡献的技术人员和经营管理人员。同时合芜蚌自主创新综合试验区科技成果处置权、处置收益权、股权激励税收等也比照中关村示范区政策执行。
一揽子激励创新的政策为试验区创新引擎加足马力，1月至5月，试验区共获发明专利授权1363件，增长20.6%；实现技术合同交易额27.6亿元，占全省的83.4%。合肥云杉光电科技有限公司研发的LED灯光源模组用交流直接驱动技术，代替了以前笨重昂贵的开关电源，不仅使产品的生产成本降低了20%，而且使它的使用寿命延长了3倍到5倍。今年初在世界三大发明展之一的日内瓦国际发明展中成功斩获银奖，项目产业化后预计年产值将达数百亿元。公司产品总监李雪白告诉记者，公司创立不到两年，自身的研发投入比较高，不过合芜蚌试验区相关政策对企业创新支持力度非常大，企业使用的厂房和办公室租金都有优惠，今年还会拿到政府大概60万元的项目经费支持。
在合芜蚌试验区推动下，全省高新技术产品实现出口22.2亿美元，增长1.6倍，总量占全省出口的18.5%，提高11.4个百分点。有效发明专利拥有量达到13630件，每万人口有效发明专利拥有量2.28件，同比增长46.8%，增幅居全国第一位。
