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1、手动三通阀有两个阀芯和阀座结构与双座阀类似，但在三通阀中，一个阀芯与阀座间的流通面积增加时，另一个阀芯与阀座间的流通面积减少。而在双座阀中两个阀芯与阀座间的流通面积是同时增加或同时减少的。
2、手动三通阀的气开和气关，只能通过选择执行机构的正作用与反作用来实现，而在双座阀中气开和气关则可以直接通过将阀体或阀芯与阀座反装来实现。
3、当手动三通阀用于需要流体进行配比的控制系统时，由于它能同时代替一个气开控制阀和一个气关控制阀，因此可以降低安装成本和减少安装空间。
4、手动三通阀也可用于旁路控制的场所，例如一路流体需要经过换热器换热，另一路流体不需要经过换热器换热，当三通阀安装在换热器前时采用分流三通阀，当三通阀安装在换热器后时采用合流三通阀。由于安装在换热器前的三通阀中流过的液体具有相同温度，因此泄漏量较小，安装在换热器后的三通阀中流过的液体有不同温度，对阀芯和阀座的膨胀程度不同，因此，泄漏量较大。通常，两股液体的温度差不宜超过150度。