流体的过滤机理主要有2种，一种是基于颗粒的大小来分离，例如拦截、筛分和表面捕获等;另一种是吸附，即颗粒在化学/电荷作用下粘附在滤器上。这就要求各个药厂根据自身的实际需要来选择不同的蓝式过滤器。与流体的特性有关。例如，流体的粘度和化学/离 子成分，流体的粘度越大在同样的压力条件下流速越慢，流体与膜之间有较多接触，过滤效果较好;再如，流体和膜的混合/接触时间对过滤效果也有较大影响，混合/接触时间越长则过滤效果越好。此外，需要注意的是，流体的特性只影响膜对流体的吸附截留效果而不影响颗粒大小的排除。与实际操作条件有关，如颗粒的流速和过滤压力。要想取得好的过滤效果，一般选择较低的流速，流速越 低截留效果越好。
过滤器一般分为蓝式过滤器、精密过滤器和管道过滤器3种。蓝式过滤器的纤维时有脱落，不能给出一个确切的孔径，厚度一般在3～20mm，通常有吸附作用，并有较大的承污能力;精密过滤器的纤维一般用热粘合或膜涂布而成，可以给出额定孔径，比较薄(<1 mm)，吸附能力较小;管道过滤器的主要特点是质地坚硬，不易破碎，有曲折的通道和 非常高的内表面积，有一定的开孔率，能做完整性测试，常用于深级过滤，如Y型过滤器。
实践证明蓝式过滤器的结构移动对过滤是不利的，一旦膜的结构在过滤过程中发生了变化，则颗粒和纤维就能从Y型过滤器析出，影响到过滤效果。但是，速度/压差仅对吸附截留有重要影响，对大小排除影响相当小。颗粒类型与过滤效果也有很大关系，颗粒分为可变 形颗粒和不可变形颗粒2种。在一定的压力下，可变形颗粒会进入管道内并导致更多的过滤网孔堵塞，从而影 响到过滤效果，如凝胶的过滤。然而，不可变颗粒过滤时则会在滤膜上形成一层类似饼状的物体。
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